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概述
本 Skill 专为生物医学与生命科学论文配图设计，内置 40 种统计与可视化图表类型，覆盖从基础描述统计到高阶临床研究的完整作图需求。用户只需准备标准 JSON 数据文件，即可通过单条命令输出 600dpi 的 PDF、TIFF、SVG 或 PNG 文件，并自动完成数据校验、色盲安全配色、中文字体检测与像素级重叠验证。图表类型包括 KM 生存曲线（含竞争风险 Aalen-Johansen 模式）、Meta 分析三件套（森林图/漏斗图/Galbraith 径向图）、预测模型六件套（ROC/校准曲线/决策曲线/列线图/RCS/亚组森林图）、PRISMA 流程图、CONSORT 式流程图、肿瘤学瀑布图与游泳图等。组合图功能支持多面板 A+B+C 的期刊标准 figure 布局，配合 --pub-ready 一键生成投稿包。
技能包含
SKILL.md：技能主说明（本文件），含触发条件、40 种图表命令速查、校验规则与退出码scripts/gen_figure.py：核心渲染引擎，单命令出图，支持--wizard选图向导与--quick自动选型scripts/setup_env.py：环境一键准备，含依赖安装、CJK 字体检测与缓存清理scripts/audit_pdf.py：投稿前字号门禁检查examples/：28 个示例文件，涵盖 16 种图型的标准 schema 与 13 个真实世界临床/组学/Meta 分析数据集references/quickstart.md：独立快速入门，含完整选图决策树与上手四步references/cheatsheet.md：全参数速查手册references/limits.md：能力边界与超限行为说明（含看门狗超时/内存降级机制）references/data-formats.md：JSON schema 详解与 CSV/Excel 兼容说明references/composite-layouts.md：多面板组合图拼版规则与span跨行跨列用法references/color-guide.md：9 套配色方案（含 Okabe-Ito 色盲安全与 NEJM/Lancet/Science 期刊色板）references/python-api.md：Python 内调用与 subprocess 集成方式references/faq.md/references/pitfalls.md：常见问题与中文环境避坑指南mcp/：MCP 服务器适配代码与端到端测试（server.py、tests/e2e.py等）.github/workflows/tests.yml：持续集成验证门禁
核心能力
- 单命令出图：
python3 scripts/gen_figure.py -t 图型 -d 数据.json -o 输出完成渲染，支持 40 种图表类型 - 投稿级验证：
--verify像素重叠检查（exit 2 即返修）、--pub-ready自动启用色盲安全主题 + 多格式输出 + 验证门禁 - 期刊预设直出：
--journal nature/lancet/nejm/science/cma/cn-core锁定官方栏宽、字号、DPI，忽略自定义宽度 - 中文零配置：
--cjk自动检测数据中文字符并匹配系统 CJK 字体，含生僻字与补充平面支持 - 统计内建：KM 的 log-rank 与中位生存 CI、
forest --stats cox多因素 Cox 回归与 PH 检验、ROC 的 DeLong 对比、Meta 的 Egger 偏倚检验等 - 智能防护：18 种 schema 结构校验（致命错误 exit 1 不落盘）、自适应超时看门狗（30~1800s）、内存不足自动降级重试
- 组合图拼版：
-t composite多面板布局，panel_labels自动角标，span跨行跨列，含占位重叠检测
应用场景
| 用户怎么说 | 本技能做什么 |
|---|---|
| "帮我画一张 KM 生存曲线，要风险表和 log-rank P 值" | 用 -t km 输出阶梯函数图，自动附加删失标记、风险表、中位生存 95%CI；若 events≥2 编码自动切换 Aalen-Johansen 竞争风险模式 |
| "Meta 分析要森林图加漏斗图，再做个 Egger 检验" | 分别用 -t forest、-t funnel --egger 生成；Galbraith 径向图 -t galbraith 补充异质性与离群点可视化 |
| "预测模型需要 ROC、校准曲线、决策曲线、列线图" | 依次用 -t roc、-t calibration、-t dca、-t nomogram 出图；六件套可后期用 -t composite 拼为多面板 figure |
| "投稿 Nature，图要双栏宽、600dpi、色盲安全" | 加 --journal nature --verify（或 --pub-ready），自动应用 Nature 栏宽/字号/DPI，锁定色盲安全 Okabe-Ito 配色，输出前通过像素重叠与字号门禁 |
| "数据里有中文分组，之前 matplotlib 乱码" | 加 --cjk，引擎递归检测数据内中文字符，自动调用系统 CJK 字体；无字体环境运行 setup_env.py 检测并提示安装 |
| "要做亚组森林图，但还没拟合 Cox 模型" | 用 -t subgroup --stats cox，引擎逐层拟合 Cox 回归（Efron 核），输出 HR+95%CI 与似然比 P 交互，直接可视化 |
| "系统综述的 PRISMA 流程图，数字要对得上" | -t prisma 自动校验各阶段数字自洽，对不上拒绝出图；lang=zh 输出中文标准版 |
| "想把 A 图的柱状图和 B 图的箱线图拼成一个 figure" | -t composite 定义多面板布局，每面板指定独立图表类型与数据源，panel_labels:true 自动加粗角标，支持 span 跨行跨列 |